夏 境内有莘国、亳邑和贯国。
商 商汤建都于亳，境内为王畿之地。北部仍为有莘国。中兴君主盘庚所居之地名盘庚村，在今城南10里王老林一带。
周 今境域南部属宋国；北部属卫国，西北有左氏、安阳邑；北边境为曹国南山。春秋时，今境北部属曹国，南部属宋国。曹伯阳十五年（公元前487年），宋灭曹，其地并入宋。战国时，宋灭、卫衰，今境域西部属魏国，其余部分属楚国，有楚丘邑、己氏邑、安阳邑。
秦 南、中部属砀郡蒙县；西北部属东郡冤句县；西南部属砀郡济阳县；北部属东郡定陶县；东部属东郡武城县，境内有安阳邑。
西汉 中部属兖州山阳郡薄县，南部属梁国蒙县、己氏县，西南部属山阳郡甾县、陈留郡济阳县，西北部属济阳郡冤句县，北部属济阴郡定陶县，东北属山阳郡成武县，东南为豫州梁国已氏县。
东汉 薄县改属梁国，成武县治由楚丘迁东北三十里文亭山左（今成武县城），成武、己氏两县改属济阴郡，甾县改称考城。其他未变。
三国 全境为曹魏所辖，建置未变。
西晋 撤薄县入蒙县，治所在小蒙城（今名蒙墙寺，建国后划入商丘县，今属睢阳区）。
东晋 今境先后属后赵、前燕、前秦、后燕、东晋等国，南部为梁郡，北部为济阴郡。
南北朝 北部先属南朝宋北济阴郡，后属北朝魏济阴郡；南部先属南朝宋沛郡，后属北朝魏沛郡。魏孝昌三年（527），设西兖州于济阴郡定陶，后徙治左城（今曹县申楼西）。西兖州辖济阴、沛二郡。沛郡辖蒙县、已氏等县，济阴郡辖冤句、定陶、安阳等县。历北齐，废沛郡及安阳、己氏二县。至北周宣政元年（578），改西兖州为曹州。
隋 开皇四年（584），复置己氏县，六年改为楚丘县，属宋州（梁郡），治己氏邑。同年，于定陶县西南部济阴县，为济阴郡附郭，与曹州同治左城，今县北境分属冤句、济阴、定陶、成武四县；于古贯城（今县城西南十里）分置黄县，十八年改黄县为蒙泽县。大业二年（606），改曹州为济阴郡，废蒙泽县入济阴县。
唐 武德四年（621）改济阴郡为曹州，复于蒙泽旧地置蒙泽县，贞观二年（650），省蒙泽县入济阴县。今县境西北属曹州冤句县。曹、宋二州属河南道。东南为楚丘县，属河南道宋州睢阳郡。
五代 先后为后梁、后唐、后晋、后汉、后周所辖，建置袭唐。
宋 设县袭前朝。冤句改为宛亭，曹州改为兴仁府，济阴、宛亭二县属之。楚丘初属归德军，后属拱州、应天府。
金 冤句县治毁于水患，撤县并入济阴。大定八年（1168）河决，曹州及济阴县治毁圮，州、县北迁四十里，治于北魏乘氏（今菏泽市区）。
元 东南属楚丘县，西南属考城县，北属济阴县，并隶曹州。
明 洪武元年（1368），济阴并入曹州，以河患、徙州于安陵。二年，再迁于盘石镇（今曹县城），省楚丘县入曹州。四年，降曹州为曹县，属济宁府，为设曹县之始。十八年，济宁府改为州，县随济宁州同属兖州府。正统十年（1445）十二月，分黄河北十八都，复置曹州，辖曹县、定陶县。
清 雍正十三年（1735），曹州升为府，属兖沂曹济道，曹县随属之。
民国 1914年，曹县属济宁道。1928年废道，曹县直属省。1937年，曹县划属山东省第十专署。1938年6月，曹县划属山东省第十一区行政督察专员公署，直到1948年9月，曹县国民政府解体。
1938年10月，中共苏鲁豫特委在曹县西北郭小湖建立考城抗日县政府，1939年3月撤销。1940年8月，中共鲁西南地委在县西北部建立曹县抗日县政府。1941年5月，冀鲁豫边区第三专署在县西北伊庄建立，曹县抗日政府属之。其后，第三专署相继改称第七专署，晋冀鲁豫边区二十二专署、二十专署。1943年3月，为纪念已故专员刘齐滨，改曹县抗日政府为齐滨县抗日政府。9月，于曹县东南部建立曹县抗日政府，在曹县、成武县结合部建立成曹县抗日政府，亦隶属二十专署。1944年8月，改晋冀鲁豫边区第二十专署为冀鲁豫边区第十专署。1945年9月，撤销成曹县，于青堌集建立复程县。曹县抗日政府迁至曹县城。1946年2月，改十专署为五专署。6月改曹县、齐滨、复程三县抗日政府为民主政府。1949年8月，华北人民政府平原省建立，撤销冀鲁豫边区第三和第五专署，分别改称平原省湖西、菏泽专署，曹县、齐滨属菏泽专署，复程县划入湖西专署。齐滨县并入曹县。
中华人民共和国 1952年11月30日，撤销平原省，曹县随菏泽专区改属山东省。1958年10月撤销菏泽专区，曹县属济宁专区。1959年9月，恢复菏泽专区，曹县还属。1967年3月，菏泽专属改为菏泽地区，曹县属之。2000年6月菏泽地区改为菏泽市，曹县属之。
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